gzip解压NR库的时候，报错格式违法怎么办?

来源：千锋教育

发布人：xqq

时间： 2023-10-15 17:54:49

一、gzip解压NR库的时候，报错格式违法的解决方法

1、检查NR库文件是否下载正确

NR 库文件应该是 gz 格式的，如果文件格式不正确，会导致解压失败。检查一下下载的 NR 库文件是否正确。如果不正确，尝试重新下载。

2、使用工具比对文件校验和值是否相同

文件在传输或下载过程中可能会发生损坏，也可能导致解压失败。尝试重新下载 NR 库文件，或者下载同样的文件来比较校验结果。在下载 NR 库文件之后，可以使用 MD5 校验和工具或 SHA1 校验和工具来比对文件校验和值是否相同。

3、确认解压命令的正确性

如果下载的 NR 库文件没有问题，则应该确认解压命令的正确性。在解压命令中指定正确的参数，例如 “-d” 告诉 gzip 解压缩源文件并将解压缩的文件放入目标目录中。

二、Linux gzip命令

1、简介

Linux gzip命令用于压缩文件。gzip是个使用广泛的压缩程序，文件经它压缩过后，其名称后面会多出”.gz”的扩展名。

2、语法

gzip [-acdfhlLnNqrtvV][-S <压缩字尾字符串>][-<压缩效率>][--best/fast][文件...] 或 gzip [-acdfhlLnNqrtvV][-S <压缩字尾字符串>][-<压缩效率>][--best/fast][目录]

参数：

-a或–ascii：使用ASCII文字模式。-c或–stdout或–to-stdout：把压缩后的文件输出到标准输出设备，不去更动原始文件。-d或–decompress或—-uncompress：解开压缩文件。-f或–force：强行压缩文件。不理会文件名称或硬连接是否存在以及该文件是否为符号连接。-h或–help：在线帮助。-l或–list：列出压缩文件的相关信息。-L或–license：显示版本与版权信息。-n或–no-name：压缩文件时，不保存原来的文件名称及时间戳记。-N或–name：压缩文件时，保存原来的文件名称及时间戳记。-q或–quiet：不显示警告信息。-r或–recursive：递归处理，将指定目录下的所有文件及子目录一并处理。-S<压缩字尾字符串>或—-suffix<压缩字尾字符串>：更改压缩字尾字符串。-t或–test：测试压缩文件是否正确无误。-v或–verbose：显示指令执行过程。-V或–version：显示版本信息。-<压缩效率>：压缩效率是一个介于1－9的数值，预设值为”6″，指定愈大的数值，压缩效率就会愈高。–best：此参数的效果和指定”-9″参数相同。–fast：此参数的效果和指定”-1″参数相同。

3、实例

压缩文件：

[root@runoob.com a]# ls //显示当前目录文件a.c b.h d.cpp[root@runoob.com a]# gzip * //压缩目录下的所有文件[root@runoob.com a]# ls //显示当前目录文件a.c.gz    b.h.gz    d.cpp.gz[root@runoob.com a]#

接范例1，列出详细的信息：

[root@runoob.com a]# gzip -dv * //解压文件，并列出详细信息a.c.gz:     0.0% -- replaced with a.cb.h.gz:     0.0% -- replaced with b.hd.cpp.gz:     0.0% -- replaced with d.cpp[root@runoob.com a]#

接范例1，显示压缩文件的信息：

[root@runoob.com a]# gzip -l *     compressed    uncompressed ratio uncompressed_name         24          0  0.0% a.c         24          0  0.0% b.h         26          0  0.0% d.cpp

延伸阅读1：NR库是什么

NR(Non-Redundant Protein Sequence Database)非冗余蛋白库，所有GenBank+EMBL+DDBJ+PDB中的非冗余蛋白序列，对于所有已知的或可能的编码序列，NR记录中都给出了相应的氨基酸序列（通过已知或可能的读码框推断而来）以及专门蛋白数据库中的序列号。NR库相当于一个以核酸序列为基础的交叉索引，将核酸数据和蛋白数据联系起来。

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